Les ressources naturelles contribuent non seulement à l'équilibre des écosystèmes, mais également à l'attractivité des régions, à leur valeur récréative et à la qualité générale de la vie. Elles doivent en conséquence être protégées et valorisées. La Convention relative à la conservation de la vie sauvage et du milieu naturel de l'Europe (Convention de Berne, 1979) et la Stratégie paneuropéenne de la diversité biologique et paysagère doivent également être prises en considération dans le cadre d'une politique d'aménagement intégrée.

  Des stratégies intégrées pour la gestion des ressources en eau doivent notamment inclure la protection des eaux de surface et des eaux souterraines, le contrôle des activités agricoles en matière de fertilisation et d'irrigation, le traitement des eaux usées, etc. L'adduction d'eau d'une région éloignée ne devrait être envisagée que lorsque les ressources locales sont insuffisantes ou inexploitables à un prix raisonnable. En matière de protection de la qualité des eaux potables des nappes souterraines, il est également essentiel d'établir une correspondance entre l'expansion des réseaux d'adduction d'eau et ceux d'élimination des eaux usées (réseaux d'égout et équipements de traitement).

  L'aménagement du territoire a en outre pour tâche de contribuer à la reconstitution et à la protection des écosystèmes, y compris des réseaux écologiques ainsi que des zones humides qui font partie de tels réseaux. Une attention particulière doit être portée aux espaces et surfaces sensibles et de grande valeur écologique (zones humides, etc.) qui font partie de ces réseaux.

  Pour atteindre cet objectif, divers éléments écologiques tels que les zones de proximité naturelle, les ressources en eau, les climats thérapeutiques, les friches industrielles à résorber, doivent être identifiés. Leur traitement nécessite des mesures adaptées. La construction d'un réseau écologique cohérent de zones de protection particulières au sein de l'Union européenne et des pays candidats, dénommé Natura 2000, participe, parmi d'autres mesures, à la réalisation de cet objectif.

  En coopération avec la Conférence européenne des ministres de l'Environnement («Environment for Europe»), ces réseaux devraient être développés à l'échelle de l'ensemble de l'Europe.